Z WES se to nicméně dá čekat. Většina SNPů pro genealogii je v nekódujících oblastech.
WGS data zatím nebere? Protože to by mělo základní problém s WES daty řešit. Ovšem lidi si stěžují s Genesis hodně i na matching s běžnými SNP kity, především 23andme v5, která jinam nejde. Asi to má co dělat s imputací, která se jim zatím úplně nedaří.
Ano, udělat fake jakýkoliv formát by z toho jít mělo, ovšem na to se skutečně může použít až z WGS. Už jsem předtím třeba přemýšlela, že by něco takového šlo použít třeba na tvorbu "fůzovaného" formátu z několikero různých SNP kitů
Jasně, taky tak jednoho podezřelého teď testuju nejdřív na Y-37, to byla jeho snacha ještě ochotná mu zaplatit, když sám je škrt a chce jen výsledek a ne platit :-). Jen pokud bude shoda tam, tak se přes STR moc nezjistí, jak je stará, takže upgrade pak bude nutný tak jak tak.
GEDmatch Genesis jsem zkoušel na data WES a to bylo opravu žalostné.
Jedna z možností zpracování WGS dat pro GEDmatch je vyrobit soubor CSV/TSV kompatibilní s 23andMe nebo FTDNA nebo Ancestry. Viděl jsem na to nějaké skripty, ale netestoval jsem ještě, jak moc se takto získané výsledky liší od přímých testů.
No ale už menším testem můžeš zjistit, že to dál nemá moc cenu testovat, což je taky možná vartianta ;)
A WGS IMHO není moc pro normální lidi. Zvlášť když to slouží především pro generování dat a ne jako i vyhledávací databáze atd. Pro genealogii to snad bude v budoucnu použitelné dost dobře, ale zatím to umí zpracovávat jenom GEDmatch Genesis a podle komentářů zatím vůbec ne dobře.
To jo, ale kupovat menší testy a pak upgradovat, aby se zjistilo víc, vyjde v součtu dráž no, takže i BigY může vyjít levněji, když se udělá rovnou :-)
(Jsem ve svém branchi sám a chci tam společnost, tak verbuju kde se dá, ale lidi kdo ví proč nechtěj za tohle utrácet, za co už by měli :-)) )
Přiznejme si ale, že BigY nepatří zrovna mezi nejlevnější varianty... čehokoliv ;)
Jj, z těch 23 markerů z GaP nelze určovat moc vzdálenost společného předka, jen to nějakého naznačuje. K potvrzení je nutný podrobnější Y-DNA u obou. Ale z těch STR se to stejně úplně neodhadne. Oba BigY a bude jasno :-)
