Reklama
Nepřihlášený uživatel | Zaregistrovat se
 

Téma:

Koníčky a zálibyNové

Spravuje:

Peters



Reklama



Úvod do genetické genealogie: Beginners Guide to Genetic Genealogy
Databáze české a slovenské DNA: Genebáze
Kde si lze objednat test:
Family Tree DNA - nyní asi nejvhodnější volba
FullGenomes
23andMe
Ancestry DNA
MyHeritage DNA
Forenzní DNA servis
Genomac
Kde lze nalézt shody a další zpracování genetických dat:
Ysearch - zrušeno
mitoYDNA - možná náhrada?
GEDmatch
DNA.LAND
YFull
Další informace:
Facebooková skupina Genetická genealogie
Genetická genealogie na fóru taby.cz
Fórum Anthrogenica
Klub Populární genomika (23andme, SNP, NGS a jiné záhady vaší vlastní DNA)
Klub Rodokmeny, genealogie
Blog Kuby Krcháka (zde gkg): Bohemian genetic genealogy

Trofozoit E agora? Enterram-se os mortos   e cuidam-se os vivos
Z WES se to nicméně dá čekat. Většina SNPů pro genealogii je v nekódujících oblastech.
WGS data zatím nebere? Protože to by mělo základní problém s WES daty řešit. Ovšem lidi si stěžují s Genesis hodně i na matching s běžnými SNP kity, především 23andme v5, která jinam nejde. Asi to má co dělat s imputací, která se jim zatím úplně nedaří.

Ano, udělat fake jakýkoliv formát by z toho jít mělo, ovšem na to se skutečně může použít až z WGS. Už jsem předtím třeba přemýšlela, že by něco takového šlo použít třeba na tvorbu "fůzovaného" formátu z několikero různých SNP kitů
Jasně, taky tak jednoho podezřelého teď testuju nejdřív na Y-37, to byla jeho snacha ještě ochotná mu zaplatit, když sám je škrt a chce jen výsledek a ne platit :-). Jen pokud bude shoda tam, tak se přes STR moc nezjistí, jak je stará, takže upgrade pak bude nutný tak jak tak.
GEDmatch Genesis jsem zkoušel na data WES a to bylo opravu žalostné.

Jedna z možností zpracování WGS dat pro GEDmatch je vyrobit soubor CSV/TSV kompatibilní s 23andMe nebo FTDNA nebo Ancestry. Viděl jsem na to nějaké skripty, ale netestoval jsem ještě, jak moc se takto získané výsledky liší od přímých testů.
Trofozoit E agora? Enterram-se os mortos   e cuidam-se os vivos
No ale už menším testem můžeš zjistit, že to dál nemá moc cenu testovat, což je taky možná vartianta ;)

A WGS IMHO není moc pro normální lidi. Zvlášť když to slouží především pro generování dat a ne jako i vyhledávací databáze atd. Pro genealogii to snad bude v budoucnu použitelné dost dobře, ale zatím to umí zpracovávat jenom GEDmatch Genesis a podle komentářů zatím vůbec ne dobře.
To jo, ale kupovat menší testy a pak upgradovat, aby se zjistilo víc, vyjde v součtu dráž no, takže i BigY může vyjít levněji, když se udělá rovnou :-)
(Jsem ve svém branchi sám a chci tam společnost, tak verbuju kde se dá, ale lidi kdo ví proč nechtěj za tohle utrácet, za co už by měli :-)) )
Trofozoit E agora? Enterram-se os mortos   e cuidam-se os vivos
Přiznejme si ale, že BigY nepatří zrovna mezi nejlevnější varianty... čehokoliv ;)
Jj, z těch 23 markerů z GaP nelze určovat moc vzdálenost společného předka, jen to nějakého naznačuje. K potvrzení je nutný podrobnější Y-DNA u obou. Ale z těch STR se to stejně úplně neodhadne. Oba BigY a bude jasno :-)