Reklama
Nepřihlášený uživatel | Zaregistrovat se
 

Téma:

Koníčky a zálibyNové

Spravuje:

Peters



Reklama



Úvod do genetické genealogie: Beginners Guide to Genetic Genealogy
Databáze české a slovenské DNA: Genebáze
Kde si lze objednat test:
Family Tree DNA - nyní asi nejvhodnější volba
FullGenomes
23andMe
Ancestry DNA
MyHeritage DNA
Forenzní DNA servis
Genomac
Kde lze nalézt shody a další zpracování genetických dat:
Ysearch - zrušeno
mitoYDNA - možná náhrada?
GEDmatch
DNA.LAND
YFull
Další informace:
Facebooková skupina Genetická genealogie
Genetická genealogie na fóru taby.cz
Fórum Anthrogenica
Klub Populární genomika (23andme, SNP, NGS a jiné záhady vaší vlastní DNA)
Klub Rodokmeny, genealogie
Blog Kuby Krcháka (zde gkg): Bohemian genetic genealogy

Trofozoit Where the fear has gone there will be -  nothing. Only I will remain.
Tak mi konečně MyHeritage dopočítal shody.
Celkem zajímavá je hned ta první, protože v rodokmenu má už prarodiče zjevně české přistěhovalce a celkově jde o druhou nejlepší shodu celkem co mám (ale to není tak šokující). Nejlepší má na 23andme nějaký anonym.
Při té příležitosti jsem ehm zjistila, že mi psala loni třetí v pořadí shod, jestli neznám její praprababičku, asi jsem to upozornění náhodně odklikla a pak tam už nešla ;)

Ale ten pán z MyHeritage má jednu větev evidentně z Plzně (příjmení které se vyskytuje i dnes v ČR jen osmkrát a všechno v Plzni a vedlejším okrese), další jsou bohužel běžné jména, ale nic moc mi neříkají.
Články
https://bgengen.blogspot.cz/2016/10/zaciname.html
https://bgengen.blogspot.cz/2016/11/jak-premluvit-shody-na-23andme-ke.html
https://bgengen.blogspot.cz/2016/12/prace-s-dna-shodama-na-23andme.html

mě přiměly k otázce, jak kdo využíváte genetické autosomální shody a co se vám podařilo vypátrat?

Dat je strašně moc, ale co s nimi? článku píše o téměř 3000 shodách, co se dívám, tak já mám shod:
Ancestry DNA: 3550
23andMe: 735
FTDNA: 174
GEDMATCH: 2000
DNA.LAND: 4
MyHeritage DNA: 3
geni.com: 5
a to mám shod hodně málo.

Úspěchů mám ale minimum, předpovídané příbuznosti jsou příliš optimistické.

Jednu shodu jsem spojil matrikami na FTDNA.
Odhad FTDNA: 2nd Cousin - 4th Cousin (62 cM celkem, 29 cM nejdelší úsek)
Skutečnost: 5th Cousin

Druhou jsem identifikoval na 23andMe, ale tu už tam kupodivu nevidím, tam byl odhad také 2nd-4th cousin a realita byla tuším 7th cousin kdesi v 17. století.
 
Zajímavé je, že mi na Geni vyběhla Y-STR a mtDNA shoda s profilem "HIDDEN" Soucek"

Spekulativní příbuzný
Genetická vzdálenost: 2
93 markers matched out of 95 markers compared

Genetická vzdálenost: 1
HVR1, HVR2

A správcem jsem já! (?)

Profil má různá genetická data:

To by mě zajímalo, kde ta data vzali. Y markery mám na Ysearch, mtDNA na 23andMe, oboje na YFull, že by odtud?

@Peters Souhlas, na Geni se da mtDNA a Y STR uploadnout jen z FTDNA, alespon prozatim. K MH: Uplne prvni pocitani shod na MH trvalo neznamou dobu, protoze se data uploadovala nekolik mesicu predtim, nez byly jakekoliv vysledky. Po tom co MH zaclo dava (zcela irelevantni) vysledky doba zpracovani dat postupne rostla (az ke ~dvoum mesicum). Asi i proto, ze uz dal nechteli lidem davat absurdni shody. Po prepracovani dat (velkem zprisneni posuzovani shod na imputovanych datech) byly vysledky asi za 2 tydny. Na blogu psali jak to budou postupne zrychlovat na tyden, az na instatni rychlost. Asi se to tak uplne nepovedlo. 20 kitu je pekny balik - smekam klobouk.
 
mtDNA v GENBANK
Po vytváření stromu mtDNA http://www.phylotree.org/ se využívají data v GENBANK.

Zdá se mi, že jich tam přibývá hodně pomalu, takže pokud někdo máte kompletní test mtDNA, tedy HVR2+CR+HVR1, pozice 1 až 16569, např. mtFull Sequence u FTDNA, lze tam výsledek přidat.

Já jsem to pro všech "svých" 10 otestovaných lidí udělal přede dvěma lety.

Použil jsem postup popsaný Ianem Loganem zde: http://www.ianlogan.co.uk/submission.htm

A tohle třeba výsledek pro mě: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KJ919975

Tady je pak vidět přehled celé J1c1 zpracovaný Ianem Loganem: http://www.ianlogan.co.uk/sequences_by_group/j1c1_genbank_sequences.htm

Od správce stromu mám pro příští vydání slíbenou haploskupinu J1c1i. :-)
 
Na MyHeritage jsem nahrál data 20 lidí před týdnem, ale zatím ani jedna shoda, což je dost divné. Svoje data jsem nahrál 24.11.2016 a výsledek je zatím jak píši níže - 3 nekvalitní shody.


Díky za informaci, bohužel:

Na Geni se nenachází žádné profily, jejichž Y-DNA by se shodovala s vaší. V případě nalezení nové shody budete informováni.

Na Geni se nenachází žádné profily, jejichž mitochondriální DNA by se shodovala s vaší. V případě nalezení nové shody budete informováni.

Sice: Na Geni se nachází 5 profilů, jejichž autosomální DNA se shodují s vaší.

Ale ani náznak povědomého příjmení nebo aspoň vazby na Čechy.


Možná jsem to tedy ještě dostatečně neprozkoumal, ale nevidím, jak přidat STR a mtDNA markery jinak než propojením s účtem FTDNA.
MyHeritage DNA na blogu
 
Na GENI, coz je satelit vlastneny MH lze vkladat MtDNA i Y STR markery.
 
Jenom atDNA.
Lze na MyHeritage nahrát i analýzu z testů yDNA a mtDNA nebo jen atDNA(FTDNA - Family Finder) ?
 
To nahrání z jiných služeb tam už snad nějakou dobu je, nevím přesně v jaké podobě.

Mě už zpracovali:

3 DNA shod nalezeno

Nížeuvedené DNA Shody jsou nižší kvality, shody, na které je třeba pohlížet s nedůvěrou.

:-)

Zkusil jsem to a před posledním kliknutím mě to nabízí : "Nahrát datový soubor".
Trofozoit Where the fear has gone there will be -  nothing. Only I will remain.
To asi víte, že MyHeritage spustil vlastní službu na genealogické markery. Mimo to ale umožňuje uživatelům nahrát full data z jiných služeb (asi zdarma), jako FTDNA a 23andme.
Zkoušela jsem to, ale zatím píšou dva dny, že to pořád zpracovávají.
 
Jak správně píše Jiffy, rád to vyvěsím na Genebází. A děkuju za založení . :-)
Koukám, špatně jsem zapsal odkaz. Ano, ty různě mutující markery asi budou dělat paseku.
Tady jsem použil nástroj Y-DNA TiP Report od FTDNA pro konkrétní existující shody. Když tak nad tím přemýšlím, tak ten výpočet může být závislý na tom, které markery se liší. Možná, v URL vidím jen gd=2, takže kdo ví.

Také jsem používal http://www.mymcgee.com/tools/yutility.html?mode=ftdna_mode - ale netuším, co je správnější.
A abych tedy přispěl námětem, vzpomněl jsem si na jednu věc, a to odhad přibližné příbuznosti. Inspiroval mě k tomu Petersův příspěvek v genealogicém auditku, kdy vkládal v odpovědi na jeden dotaz tuto informaci:

Pravděpodobnost příbuznosti při shodě 25/25 markerů:
4 generací = asi 133 let: 61.17%
8 generací = asi 266 let: 84.92%
12 generací = asi 400 let: 94.15%
16 generací = asi 533 let: 97.73%

Pravděpodobnost příbuznosti při shodě 37/37 markerů:
4 generací = asi 133 let: 83.49%
8 generací = asi 266 let: 97.28%
12 generací = asi 400 let: 99.55%
16 generací = asi 533 let: 99.93%

Pravděpodobnost příbuznosti při shodě 33/37 markerů:
4 generací = asi 133 let: 30.24%
8 generací = asi 266 let: 70.33%
12 generací = asi 400 let: 90.14%
16 generací = asi 533 let: 97.14%

Chtěl jsem se zeptat, jaké zdroje pro odhad příbuznosti využíváte? Já používám MRCA Calculator, který ale ukazuje úplně jiné hodnoty při zadání výše uvedených údajů a který navíc dlouhodobě podezřívám, že je až moc mimo (velmi daleko) při určování vzdálenosti, resp. pravděpodobnosti společného předka.
 
Díky za založení.

Archivu se určitě ujme rád Lodovico na Genebázi.
Založil jsem tento klub jako náhradu za zaniklé auditorium Genetika a genealogie na serveru MAGEO.

Přívítám spolumoderátory a náměty.

Mám archiv příspěvků z Magea 9.8.2009 až 24.3.2016, pokud by je chtěl někdo vystavit na webu, tak je to možné, i když zrovna nevím kam.