Reklama
Nepřihlášený uživatel | Zaregistrovat se
 

Téma:

Koníčky a zálibyNové

Spravuje:

Peters



Reklama



Úvod do genetické genealogie: Beginners Guide to Genetic Genealogy
Databáze české a slovenské DNA: Genebáze
Kde si lze objednat test:
Family Tree DNA - nyní asi nejvhodnější volba
FullGenomes
23andMe
Ancestry DNA
MyHeritage DNA
National Geographic
Forenzní DNA servis
Genomac
Kde lze nalézt shody a další zpracování genetických dat:
Ysearch - zrušeno
mitoYDNA - možná náhrada?
GEDmatch
DNA.LAND
YFull
Další informace:
Fórum Anthrogenica
Klub Populární genomika (23andme, SNP, NGS a jiné záhady vaší vlastní DNA)
Klub Rodokmeny, genealogie
Blog Kuby Krcháka (zde gkg): Bohemian genetic genealogy

Trofozoit E agora? Enterram-se os mortos   e cuidam-se os vivos
Důkazní váha je ale v tomto případě na kolegovi, ne na vás :)
SANOV Střední Čechy 
Tak hluboce nejsem zběhlý. Mám spor s kolegou, který mi tvrdí, že se v ČR nechalo testovat na určení původu předků pomocí analýzy DNA už více než 100.000 lidí, to se mi zdá až moc přehnané.
Určitě ne.

Data od všech organizací provádějících testy nebudou k dispozici.

I kdyby byly, trvalé bydliště se nikde nevyplňuje.

I kdyby vyplňovalo, nešlo by eliminovat duplicity.


Ostatně, co myslíte tím původem? Y-Dna, Au-ANA nebo mtDNA?
SANOV Střední Čechy 
Lze najít pravdivý údaj, kolik občanů žijících trvale v ČR si nechalo testovat DNA na původ.
 
Trofozoit E agora? Enterram-se os mortos   e cuidam-se os vivos
Spammer.
elizaddd Works in biochemistry field 
infomativní
Zajímavé vlákno a velmi infomativní. Označím to pro pozdější čtení. --------- z Creative Peptides
 
To tam přidali až někdy možná před půl rokem, předtím tam měli maximálně VCF a BAM jen na disku.
Na https://us.dantelabs.com/collections/our-tests/products/whole-genome-sequencing
přímo píší: "FASTQ, BAM, VCF files available for download free of charge (VCF files include SNPs, INDELs, CNV and SV)"

Vzdálený příbuzný z U.S. očekává v květnu výsledky. Při objednávce požadoval všechna data přes cloud,
jsem zvědav s čím Dante přijde.
Mají tam teď garanci výsledků do 90 dnů jinak vrácení peněz: https://www.dantelabs.com/blogs/news/whole-genome-offer-for-dna-day-2019

Uvidíme.

BAM by snad měli časem umět nahrát na sequencing.com: https://sequencing.com/dante-labs ale zatím to nefunguje.
Akce - poslední den
Dante má v akci WGS za 199E, což je slušné. dneska je to poslední den. Výsledky ale byly za půl roku a bez BAM file, za ten jsem připlatil 69E a ještě mi ho stále neposlali. (zatím čekám 2 měsíce)
 
Trofozoit E agora? Enterram-se os mortos   e cuidam-se os vivos
Ani SNPy takovým způsobem nevznikají. Samozřejmě určité látky nebo životní styl (kouření, alkohol, strava, práce nebo život v toxickém nebo nezdravém prostředí) mohou zvyšovat riziko poškození DNA v buňkách, ale zdaleka nejvyšším zdrojem poškození a následných možných mutací je samotný oxidativní metabolismus každé buňky.
A nebo chyby vznikající při kopírování DNA, ty nejsou taky zřídka a jsou úplně nezávislé na poškození DNA.

Další věcí je že ty změny se musí stát přesně v buňkách tvořících gamety, které bývají dost chráněné. U žen se tvoří už v embryu a zůstávají v klidové fázi až do puberty.
U mužů se tvoří celý život, takže je prokázané že muži mající děti v pozdějším věku jim mohou přenášet výše SNPů. Ale ne tak událostmi v životě, ale prostě tím že ty buňky jsou starší a déle vystavené působením metabolismu a jiných věcí.
honyk Východní Čechy 
 
honyk Východní Čechy 
Díky moc za objasnění. Dobré vědět. Já si tak trochu naivně myslel, že to souvisí s nějakou zlomovou situací během života (nemoc, stres, strádání, změna prostředí), kdy se v těle něco pohne a způsobí mutaci, která se přenáší na potomky :-) Takže vlastně něco, co píšete s tou SNP.
Trofozoit E agora? Enterram-se os mortos   e cuidam-se os vivos
K mutacím měnícím počet repetic STR dochází téměř výhradně během meiosy, což je u mužů během tvorby spermií. Při oplodnění ne a v průběhu života se mohou u mužů kumulovat v zárodečných buňkách SNPy ale změny v STR ne.
Nicméně každá taková změna se pak týká jen těch daných spermií a ne "všech následujících po nich", rekombinace se dějí vždycky nanovo z původního počtu repetic.
Z toho bych odhadovala, že situace kdy všichni synované mají stejnou de novo změnu STR dojde velice vzácně a pak by to pravděpodobně mohla být nějaká ještě komplikovanější genetická piškuntálie. Ale prakticky nevím, třeba má někdo vlastní zkušenosti.

Co se frekvence změn týká, zjevně existují i tzv. rapidly mutating (RM) Y-STRs, které se mohou lišit i mezi bratry.

Při hledání jsem našla tenhle zajímavý forenzní článek, který popisuje historii jednoho holandského případu ale obsahuje zajímavou historii a dokonce využití Y-DNA pro určení etnicity ve forenzní genetice, příbuznosti a dokonce forenzní
genealogie v kombinaci s Y-DNA. Cool.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5418305/
honyk Východní Čechy 
Zdroj STR mutací
Existují nějaké odhady, ve které fázi dochází ke změně hodnot STR markerů? Ve fázi tvorby spermie, při oplodnění, nebo v průběhu života? Nebo jinak, jak časté jsou případy, kdy mají všichni synové stejnou mutaci a kdy naopak se mutace projeví buď jen u jednoho, případně jen u těch mladších.
 
Trofozoit E agora? Enterram-se os mortos   e cuidam-se os vivos
Ti tam ale taky přišli z Afriky :)
Reakce na | Vlákno  
VAN Střední Čechy, Pardubice a okolí  
Zajímavá knížka.
Trochu bych nesouhlasil s tím, že neandrtálci přišli z Afriky. V Evropě se nacházeli tvorové podobní lidem už před milionem let. Podnebí se mnohokrát měnilo. S původem Trolliho uvažuji, že to bylo jinak. Geny neandrtálců jsme dostali přes matku z rodu neandrtálců. Jinak bych nemohl mít R1a. Potěšilo mě přeložené schéma Klany R1a.
Lodovico Mas syndrom stoleti? Je mi to jedno! 
Vcera jsem si koupil toto: Zatim jen prvnich par desitek stranek. Ctive a poutave.
 
VAN Střední Čechy, Pardubice a okolí  
No řídit se jedním STR markerem není moc spolehlivé, DYS481 mají sice vyšší často v R1a, ale jsou lidi, co mají skupinu R-DF27, tedy hluboko pod R1b, a mají tenhle marker 25 taky...
Odkazy vám automaticky převede na klikací, když při psaní příspěvku přepnete vlevo dole na Text (místo HTML)
Reakce na | Vlákno